Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC11A1P49279 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms