Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM4P49221 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM4P49221 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGM4P49221 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGM4P49221 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGM4P49221 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms