Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UTRNP46939 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UTRNP46939 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UTRNP46939 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms