Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4P46934 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms