Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDF5P43026 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDF5P43026 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDF5P43026 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms