Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CBP42338 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms