Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK1P39086 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms