Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms