Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPC1P35052 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPC1P35052 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPC1P35052 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms