Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC1P33527 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC1P33527 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC1P33527 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms