Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTX1P32242 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTX1P32242 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX1P32242 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX1P32242 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX1P32242 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms