Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL4A5P29400 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms