Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms