Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms