Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
SPB1P25582 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
SPB1P25582 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.06□□□□□ -2.24
SPB1P25582 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
SPB1P25582 SPT7YBR081C 3999 nt1.06□□□□□ -2.24
SPB1P25582 RAD61YDR014W 1944 nt1.05□□□□□ -2.24
SPB1P25582 BEM2YER155C 6504 nt1.04□□□□□ -2.24
SPB1P25582 GEA2YEL022W 4380 nt1.04□□□□□ -2.24
SPB1P25582 BUD3YCL014W 4911 nt1.04□□□□□ -2.24
SPB1P25582 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.04□□□□□ -2.24
SPB1P25582 IES4YOR189W 351 nt1.04□□□□□ -2.24
SPB1P25582 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.03□□□□□ -2.24
SPB1P25582 YPR117WYPR117W 7470 nt1.03□□□□□ -2.25
SPB1P25582 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
SPB1P25582 ISD11YER048W-A 285 nt1.02□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YGR069WYGR069W 336 nt1.02□□□□□ -2.25
SPB1P25582 MCM10YIL150C 1716 nt1.02□□□□□ -2.25
SPB1P25582 SGF11YPL047W 300 nt1.02□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.02□□□□□ -2.25
SPB1P25582 CMC4YMR194C-B 222 nt1.01□□□□□ -2.25
SPB1P25582 NOP9YJL010C 2001 nt1.01□□□□□ -2.25
SPB1P25582 PAA1YDR071C 576 nt1□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YPL044CYPL044C 549 nt1□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YDL196WYDL196W 330 nt0.99□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YNL211CYNL211C 261 nt0.99□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YOR015WYOR015W 360 nt0.99□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YOR282WYOR282W 321 nt0.98□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.97□□□□□ -2.25
SPB1P25582 DOP1YDR141C 5097 nt0.97□□□□□ -2.25
SPB1P25582 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
SPB1P25582 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.96□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.96□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.95□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YGL052WYGL052W 306 nt0.95□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YER181CYER181C 324 nt0.94□□□□□ -2.26
SPB1P25582 RPL26BYGR034W 384 nt0.94□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YPR092WYPR092W 306 nt0.94□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.93□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.92□□□□□ -2.26
SPB1P25582 BFR2YDR299W 1605 nt0.92□□□□□ -2.26
SPB1P25582 PMP1YCR024C-A 123 nt0.91□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.91□□□□□ -2.26
SPB1P25582 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.9□□□□□ -2.27
SPB1P25582 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.9□□□□□ -2.27
SPB1P25582 ASE1YOR058C 2658 nt0.9□□□□□ -2.27
SPB1P25582 STF2YGR008C 255 nt0.89□□□□□ -2.27
SPB1P25582 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.89□□□□□ -2.27
SPB1P25582 UBP3YER151C 2739 nt0.87□□□□□ -2.27
SPB1P25582 snR74snR74 88 nt0.87□□□□□ -2.27
SPB1P25582 YDL073WYDL073W 2955 nt0.87□□□□□ -2.27
SPB1P25582 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.87□□□□□ -2.27
SPB1P25582 snR49snR49 165 nt0.87□□□□□ -2.27
SPB1P25582 PRP16YKR086W 3216 nt0.86□□□□□ -2.27
SPB1P25582 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.86□□□□□ -2.27
SPB1P25582 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.86□□□□□ -2.27
SPB1P25582 HUG1YML058W-A 207 nt0.86□□□□□ -2.27
SPB1P25582 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.86□□□□□ -2.27
SPB1P25582 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
SPB1P25582 SEC8YPR055W 3198 nt0.85□□□□□ -2.27
SPB1P25582 RKR1YMR247C 4689 nt0.84□□□□□ -2.28
SPB1P25582 snR190snR190 190 nt0.83□□□□□ -2.28
SPB1P25582 snR55snR55 98 nt0.82□□□□□ -2.28
SPB1P25582 NPR2YEL062W 1848 nt0.82□□□□□ -2.28
SPB1P25582 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.81□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.81□□□□□ -2.28
SPB1P25582 COY1YKL179C 2040 nt0.81□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.8□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YLR282CYLR282C 342 nt0.8□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.8□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.8□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.79□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.78□□□□□ -2.28
SPB1P25582 PAM16YJL104W 450 nt0.78□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.78□□□□□ -2.28
SPB1P25582 CHS6YJL099W 2241 nt0.78□□□□□ -2.28
SPB1P25582 YCR022CYCR022C 345 nt0.77□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.77□□□□□ -2.29
SPB1P25582 BLI1YKL061W 342 nt0.77□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.77□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YKU70YMR284W 1809 nt0.77□□□□□ -2.29
SPB1P25582 COX5BYIL111W 456 nt0.76□□□□□ -2.29
SPB1P25582 HAL9YOL089C 3093 nt0.75□□□□□ -2.29
SPB1P25582 FYV10YIL097W 1551 nt0.75□□□□□ -2.29
SPB1P25582 SEC1YDR164C 2175 nt0.75□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.75□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YML002WYML002W 2214 nt0.74□□□□□ -2.29
SPB1P25582 COX12YLR038C 252 nt0.74□□□□□ -2.29
SPB1P25582 RPS30BYOR182C 192 nt0.74□□□□□ -2.29
SPB1P25582 PRP5YBR237W 2550 nt0.73□□□□□ -2.29
SPB1P25582 ABF2YMR072W 552 nt0.73□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.73□□□□□ -2.29
SPB1P25582 ULI1YFR026C 510 nt0.72□□□□□ -2.29
SPB1P25582 YGL041CYGL041C 204 nt0.72□□□□□ -2.29
SPB1P25582 LTE1YAL024C 4308 nt0.71□□□□□ -2.3
SPB1P25582 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.71□□□□□ -2.3
SPB1P25582 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.7□□□□□ -2.3
SPB1P25582 OST4YDL232W 111 nt0.69□□□□□ -2.3
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