Protein–RNA interactions for Protein: P25375

PRD1, Saccharolysin, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1P25375 YBR064WYBR064W 429 nt1.17□□□□□ -2.22
PRD1P25375 RAD61YDR014W 1944 nt1.17□□□□□ -2.22
PRD1P25375 DOP1YDR141C 5097 nt1.16□□□□□ -2.22
PRD1P25375 YGR069WYGR069W 336 nt1.16□□□□□ -2.22
PRD1P25375 SCC2YDR180W 4482 nt1.15□□□□□ -2.23
PRD1P25375 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.15□□□□□ -2.23
PRD1P25375 PAU24YBR301W 363 nt1.15□□□□□ -2.23
PRD1P25375 VAM6YDL077C 3150 nt1.14□□□□□ -2.23
PRD1P25375 CDC39YCR093W 6327 nt1.13□□□□□ -2.23
PRD1P25375 OLI1Q0130 231 nt1.13□□□□□ -2.23
PRD1P25375 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.13□□□□□ -2.23
PRD1P25375 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
PRD1P25375 IES4YOR189W 351 nt1.12□□□□□ -2.23
PRD1P25375 SGF11YPL047W 300 nt1.12□□□□□ -2.23
PRD1P25375 NUP157YER105C 4176 nt1.12□□□□□ -2.23
PRD1P25375 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.11□□□□□ -2.23
PRD1P25375 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.11□□□□□ -2.23
PRD1P25375 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.1□□□□□ -2.23
PRD1P25375 MCM10YIL150C 1716 nt1.09□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YER181CYER181C 324 nt1.08□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.07□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.07□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YOR015WYOR015W 360 nt1.07□□□□□ -2.24
PRD1P25375 RPS30BYOR182C 192 nt1.07□□□□□ -2.24
PRD1P25375 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.06□□□□□ -2.24
PRD1P25375 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
PRD1P25375 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
PRD1P25375 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.06□□□□□ -2.24
PRD1P25375 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.05□□□□□ -2.24
PRD1P25375 CMC4YMR194C-B 222 nt1.05□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YNL211CYNL211C 261 nt1.05□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.04□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YGL052WYGL052W 306 nt1.04□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YPL044CYPL044C 549 nt1.04□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YPR092WYPR092W 306 nt1.04□□□□□ -2.24
PRD1P25375 NOP9YJL010C 2001 nt1.04□□□□□ -2.24
PRD1P25375 PAA1YDR071C 576 nt1.03□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.03□□□□□ -2.24
PRD1P25375 ISD11YER048W-A 285 nt1.03□□□□□ -2.24
PRD1P25375 PAM16YJL104W 450 nt1.03□□□□□ -2.24
PRD1P25375 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.03□□□□□ -2.24
PRD1P25375 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
PRD1P25375 YDL196WYDL196W 330 nt1.01□□□□□ -2.25
PRD1P25375 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.01□□□□□ -2.25
PRD1P25375 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.01□□□□□ -2.25
PRD1P25375 YOR282WYOR282W 321 nt1.01□□□□□ -2.25
PRD1P25375 UBP3YER151C 2739 nt1□□□□□ -2.25
PRD1P25375 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.99□□□□□ -2.25
PRD1P25375 snR49snR49 165 nt0.98□□□□□ -2.25
PRD1P25375 RPL26BYGR034W 384 nt0.97□□□□□ -2.25
PRD1P25375 snR74snR74 88 nt0.96□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.96□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.96□□□□□ -2.26
PRD1P25375 BFR2YDR299W 1605 nt0.96□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YCR022CYCR022C 345 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.95□□□□□ -2.26
PRD1P25375 snR55snR55 98 nt0.93□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.93□□□□□ -2.26
PRD1P25375 PMP1YCR024C-A 123 nt0.91□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.91□□□□□ -2.26
PRD1P25375 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.91□□□□□ -2.26
PRD1P25375 ASE1YOR058C 2658 nt0.9□□□□□ -2.27
PRD1P25375 RKR1YMR247C 4689 nt0.9□□□□□ -2.27
PRD1P25375 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.89□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.89□□□□□ -2.27
PRD1P25375 snR190snR190 190 nt0.89□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YGL041CYGL041C 204 nt0.88□□□□□ -2.27
PRD1P25375 COY1YKL179C 2040 nt0.88□□□□□ -2.27
PRD1P25375 NPR2YEL062W 1848 nt0.87□□□□□ -2.27
PRD1P25375 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.86□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.86□□□□□ -2.27
PRD1P25375 SEC8YPR055W 3198 nt0.86□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YKU70YMR284W 1809 nt0.85□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.85□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YLR282CYLR282C 342 nt0.85□□□□□ -2.27
PRD1P25375 PRP16YKR086W 3216 nt0.84□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.84□□□□□ -2.27
PRD1P25375 ABF2YMR072W 552 nt0.84□□□□□ -2.27
PRD1P25375 YMR160WYMR160W 2451 nt0.84□□□□□ -2.28
PRD1P25375 BLI1YKL061W 342 nt0.83□□□□□ -2.28
PRD1P25375 YDL073WYDL073W 2955 nt0.83□□□□□ -2.28
PRD1P25375 snR8snR8 190 nt0.82□□□□□ -2.28
PRD1P25375 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.82□□□□□ -2.28
PRD1P25375 COX5BYIL111W 456 nt0.81□□□□□ -2.28
PRD1P25375 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.81□□□□□ -2.28
PRD1P25375 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms