Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2AP24928 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms