Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRR1P24046 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms