Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF4P23510 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms