Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPREP23469 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPREP23469 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPREP23469 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPREP23469 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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