Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA5P22460 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA5P22460 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA5P22460 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA5P22460 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA5P22460 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNA5P22460 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms