Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGCP20142 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGCP20142 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGCP20142 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGCP20142 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGCP20142 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGCP20142 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGCP20142 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGCP20142 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGCP20142 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGCP20142 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGCP20142 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGCP20142 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGCP20142 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms