Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT15P19012 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT15P19012 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT15P19012 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms