Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB3P16520 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB3P16520 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB3P16520 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB3P16520 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB3P16520 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB3P16520 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB3P16520 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms