Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1P11387 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1P11387 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms