Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB1P11230 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB1P11230 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms