Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms