Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHGAP10645 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHGAP10645 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHGAP10645 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHGAP10645 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHGAP10645 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHGAP10645 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHGAP10645 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms