Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms