Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM228BP0C875 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM228BP0C875 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM228BP0C875 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM228BP0C875 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms