Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms