Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms