Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYMSP04818 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms