Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRB1P04280 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms