Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV12-3P01733 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms