Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F13A1P00488 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F13A1P00488 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F13A1P00488 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13A1P00488 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13A1P00488 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13A1P00488 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13A1P00488 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13A1P00488 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13A1P00488 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms