Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED1O96006 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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