Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms