Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSTN1O94985 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms