Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG12O94817 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG12O94817 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG12O94817 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG12O94817 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms