Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3JO75822 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3JO75822 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms