Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN11O75508 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN11O75508 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms