Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSCO60682 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSCO60682 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSCO60682 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSCO60682 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSCO60682 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSCO60682 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSCO60682 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSCO60682 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSCO60682 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSCO60682 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSCO60682 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MSCO60682 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSCO60682 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms