Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms