Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE6DO43924 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PDE6DO43924 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDE6DO43924 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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