Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP6O43824 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms