Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms