Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH3O43739 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH3O43739 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms