Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms