Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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